(1) 基于质谱的蛋白构象解析
(2) 化学交联质谱方法学

1、科研项目
（1）国家自然科学基金，青年项目，81703471，天然药物靶标发现的化学蛋白质组学新技术，2018.01-2020.12，21万元，主持，已结题
（2）江苏省自然科学基金，青年项目，BK20170740，建立肝保护天然药物靶标发现新方法，2017.07-2020.06，20万元，主持，已结题
（3）南京市留学人员科技创新项目择优资助，小分子-靶蛋白互作发现/确证新策略，2018.01-2020.12，3万元，主持，已结题
2、代表性科研成果
（1）靶蛋白构象的时空分析
设计开发具有光激活特性的化学交联剂，实现对蛋白构象中间体的捕捉及结构解析。建立具有时间分辨的化学交联策略，连续捕捉靶蛋白变构过程的重要中间构象，还原靶蛋白构象变化过程，研究靶蛋白构象对下游通路选择性激活及细胞命运调控的机制。针对靶蛋白变构调节的药物设计、实现疾病治疗需要的精细药物设计都具有重要科学价值。
（2）药物靶标发现-筛选-结合模式的评价体系
通过建立原态-变性转换离子源，实现对配体/药物-靶蛋白复合物结合特异性的鉴定，并应用于复杂生物体系的快速筛选和检测。结合纳米粒子技术，可捕捉细胞裂解液中的低丰度靶蛋白，提高靶蛋白鉴定的灵敏度和准确性，为天然药物靶标发现提供共性技术支撑，提高靶标发现的特异性和准确性，对后续药物研发和机制研究具有重要意义。

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研究团队
郑秋凌副教授
博士后
阮旭俊
硕士研究生
胡姣姣（2017级）
夏丹丹（2018级）
朱梦乐（2018级）
杨蕾（2019级）
卢克贵（2019级）
王彦（2021级）
谢雨欣（2020级）
王佳雯（2021级）
周李蓉（2021级）
王盈霁（2022级）
鲍亚然（2022级）
陶俊俊（2022级）
石雪松（2022级）
许圆圆（2022级）